1920年，北洋直、皖兩系軍閥斗爭日趨尖銳。吳佩孚在對南方的戰(zhàn)爭中出力較多，而段祺瑞為擴充皖系勢力，竟任未建寸功的皖系第七師師長張敬堯為湖南督軍。吳佩孚自然不服，要求從湖南撤防北歸。

　　北京政府執(zhí)意不準(zhǔn)，吳竟自行撤防。南方軍隊乘機反攻，趕走張敬堯，光復(fù)長沙。

　　此時，馮玉祥正率領(lǐng)第十六混成旅駐防常德，也退往河南信陽。

　　武昌諶家磯暫且棲身

　　1920年7月初，直皖戰(zhàn)爭一觸即發(fā)。據(jù)傳，駐在漢口的皖系軍人、長江上游總司令吳光新有勾結(jié)張敬堯進攻漢口之意，直系將領(lǐng)、湖北督軍王占元急電馮玉祥速援漢口。第十六混成旅搭乘由小火輪牽引的民用木船，于16日到達(dá)長江沿岸的藕池口。這時，直皖戰(zhàn)爭已爆發(fā)，而吳光新已經(jīng)被王占元扣留，王又急電馮：“毋庸前來。”

　　直皖戰(zhàn)爭以皖系的大敗而結(jié)束。北京政府已為直、奉兩系軍閥所控制。此刻第十六混成旅無處屯駐，只得沿長江順流而下，在武昌鲇魚套暫住。鄂督王占元指定江北的諶家磯造紙廠暫為十六混成旅駐地，但不供給糧餉。

　　第十六混成旅名為一個旅，實際上比一個師還大，有1萬多人，大部駐諶家磯造紙廠，另有一部駐距諶家磯20里的灄口。造紙廠房屋不夠住，官兵就住進帳篷，時值酷暑，天氣濕熱，如同身在蒸籠內(nèi)。加上瘟疫流行，官兵患霍亂者極多，3個月時間竟病故200余人。

　　馮玉祥在駐軍諶家磯期間，曾派營副王冠軍、王書箋(王義元)去河南鄭州、山東曹州（今曹縣）和安徽蒙城募兵。旅部又從招募來的新兵中挑選126名學(xué)生，組建學(xué)兵第二連，調(diào)四團一營四連連長張自忠到旅部任學(xué)兵第二連連長(學(xué)兵隊下轄2個連，馮治安任隊長兼第一連連長)。

　　在河南信陽艱苦度日

　　同年11月上旬，好不容易天氣漸涼，第十六混成旅又奉北京政府命令移駐河南南部，旅部、一團、二團及炮團駐信陽；三團二營及團部駐確山；三團三營駐明港；韓復(fù)榘率三團一營駐扎駐馬店。

　　此間，第十六混成旅的人事又有變動：張樹聲因故請假，三團團長由四團團長張維璽充任，參謀長劉郁芬調(diào)充第四團團長，劉驥充任參謀長；谷良友調(diào)任一團三營營長，所遺之三團二營營長由學(xué)兵隊隊長石友三充任。

　　石友三瘦小精悍，好勇斗狠，治軍嚴(yán)酷，動輒打罵，曾是他屬下的馮治安、張自忠等都領(lǐng)教過他的“手段”。因此，凡是他的部屬，平時訓(xùn)練不敢有絲毫的懈怠，由他調(diào)教出來的二營，倒是各科成績優(yōu)異，在全旅堪稱翹楚。馮玉祥十分欣賞石營，每遇貴賓造訪或長官視察，必令石營演練“分列式”，以壯聲色。

　　作戰(zhàn)時，石友三常常手執(zhí)皮鞭，腰桿挺得筆直，在陣前往來穿梭，指揮戰(zhàn)斗，即使在槍林彈雨中，也從不彎腰弓背，故他的部屬誰也不敢畏縮不前。石友三深諳恩威并施之道，平時對二營官兵噓寒問暖，呵護備至；對經(jīng)濟上有困難的人，更是慷慨解囊，出手大方，因此他的部屬都甘愿追隨驥尾。韓復(fù)榘與石友三關(guān)系本來就很好，今又在一個團里同任營長，自然往還更加密切。

　　第十六混成旅因為并非曹錕吳佩孚嫡系，沒有自己的地盤，從1920年6月起，第十六混成旅就沒有得到過北京政府一文錢的軍餉，處境十分困難。第十六混成旅移駐河南信陽以來，河南督軍趙倜也不肯接濟糧餉，部隊困頓已極，官兵每日兩餐僅以鹽水就飯吃。

　　由于馮玉祥平時對部下甚厚，部隊在如此情況下依然保持忠誠。1921年年初，馮玉祥去北京要餉未果回信陽，火車途經(jīng)駐馬店站，正值風(fēng)雪交加的午夜。韓復(fù)榘率官兵一部冒著嚴(yán)寒，在站臺上肅立迎候，全成“雪人”，馮見狀極為感動，他在日記上動情地寫到：“韓營長及當(dāng)?shù)剀婈爜斫?。天極寒，官兵勞苦，予心極不忍?！?/p>

　　與河南督軍趙倜沖突

　　馮玉祥因為四方籌措糧餉無著，為緩解燃眉之急，只得截留地方稅款1.4萬元暫時度日；還將河南督軍趙倜從漢陽兵工廠訂購的1500支“七九”步槍據(jù)為己有。由此，馮、趙之間引發(fā)劇烈沖突。

　　1921年2月10日，駐防駐馬店的趙倜所部與豫南巡緝營一部因賭博而火拼，互有傷亡。韓復(fù)榘為維護地方治安，打出紅十字會旗，冒險為雙方調(diào)停。趙倜部先向韓復(fù)榘部開火，韓復(fù)榘反擊，雙方發(fā)生戰(zhàn)斗。馮玉祥部三團團長張維璽率石友三營由確山趕來增援。馮玉祥為避免事態(tài)擴大，下令撤出戰(zhàn)斗，將韓復(fù)榘部調(diào)往確山。

　　3月28日，馮玉祥得悉有一列火車要途經(jīng)信陽，車上載有稅款20萬元，遂率部分官兵前往信陽車站，攔住火車，截留其中10萬元，以充欠發(fā)的軍餉。一星期后，《大公報》即登出《馮玉祥劫皇綱》的消息，還畫了一幅馮站在鐵道上，伸開雙臂，攔截火車的漫畫。

　　不久，曾被趙倜撤職的河南陸軍第一旅旅長成慎秉承直系的意圖，協(xié)同豫北巡緝營，在彰德(安陽)自封“豫北軍總司令”，興兵討伐趙倜。馮玉祥部奉直系上層命令，準(zhǔn)備起兵在豫南呼應(yīng)成慎。

　　趙倜派李鵬舉部首先向駐確山的韓復(fù)榘營開戰(zhàn)。韓營立即應(yīng)戰(zhàn)；張之江率所部第二團自信陽馳援韓營。李鵬舉部很快就被包圍繳械。事后，趙倜向北京政府狀告馮玉祥勾結(jié)成慎作亂、扣留地方稅款、劫奪槍支；馮玉祥也向北京政府指控趙倜首先襲擊第十六混成旅駐確山的韓復(fù)榘營，馮旅“為正當(dāng)防御計，不得不派隊往御，以求自衛(wèi)，而安地方”。

　　趙倜麾下師長、歸德鎮(zhèn)守使寶德全打起“包打馮玉祥”的大旗，率部向駐馬店攻擊前進。此時，直系大將吳佩孚考慮到此時還不愿和張作霖敵對（奉系軍閥反對直系吞并河南地盤），便突然變卦，指責(zé)成慎“犯上作亂”，并派兵進攻彰德，導(dǎo)致成慎兵敗自盡。事后，吳佩孚讓馮玉祥歸還所繳獲的槍械，向趙倜賠禮道歉。馮只得從命，親赴開封向趙致歉，并將所部原有舊槍交還，趙拒收，最后不了了之。

　　入陜驅(qū)陳始有轉(zhuǎn)機

　　當(dāng)時，直系控制的北京政府下令撤換皖系陜西督軍陳樹藩，陳抗命不從。北京政府遂調(diào)集閻相文率第二十師、第七師、第四混成旅及馮玉祥之第十六混成旅開赴陜西，武力驅(qū)陳。

　　5月29日，馮玉祥的第十六混成旅官兵分由信陽、明港、確山、駐馬店登上火車，向潼關(guān)集結(jié)。按即定計劃，討伐軍分三路進攻，馮玉祥第十六混成旅任左路，走大路以南至南山山脈。馮玉祥在所部原有4個步兵團的基礎(chǔ)上，將全旅編為4個梯隊，馮親率張維璽第三梯隊擔(dān)任中央梯隊前進。

　　陳樹藩部號稱有5旅之眾，但多貌合神離，實際聽其指揮的不過5000人，根本不是直軍對手。戰(zhàn)斗一打響，第十六混成旅各梯隊便首戰(zhàn)告捷，陳樹藩部全線潰退。7月7日，馮玉祥部已經(jīng)兵臨西安城下，用野炮轟擊西安城內(nèi)督軍署。同日，陜西省長劉鎮(zhèn)華開城出迎直系大軍，陳率殘部逃往漢中。閻相文正式出任陜督，劉繼續(xù)擔(dān)任省長。不久閻相文突然自殺，馮玉祥被任命為陜西督軍，第十六混成旅的處境才有所轉(zhuǎn)機。